dzz: Dizzy の冬 (Default)
dzz ([personal profile] dzz) wrote2020-06-06 11:54 pm

(no subject)

Разработку национальной базы генетической информации поручили Курчатовскому институту.
Интересно, почему сразу не Литинституту или институту Философии РАН?

[identity profile] jno2004.livejournal.com 2020-06-06 09:11 pm (UTC)(link)

БД им поручили, не геномы

[identity profile] dzz.livejournal.com 2020-06-06 09:44 pm (UTC)(link)
Ну, ИТ - тоже не конёк Курчатника. "Демос" не вспоминать :)

[identity profile] jno2004.livejournal.com 2020-06-07 09:03 am (UTC)(link)

Нынче курчатник с ростеликом братья на век

de_nada: (Default)

Хммм...

[personal profile] de_nada 2020-06-06 09:11 pm (UTC)(link)


А мне вот интересно - WTF???

Реляционная БД, набитая результатами секвенирования "146 млн." образцов геномов.

Ии-и-и-иии... ?

С уважением.

[identity profile] dzz.livejournal.com 2020-06-06 09:14 pm (UTC)(link)
И поиск виновных в чём угодно упростится до безобразия.
de_nada: (Default)

Хех! :)

[personal profile] de_nada 2020-06-06 09:31 pm (UTC)(link)


Так понимаю, ключевое тут не ""поиск"", даже не "в чём угодно" (если, конечно, не иметь в виду "угодно "ищущим""), а ""виновных""???

С уважением.

[identity profile] dzz.livejournal.com 2020-06-06 09:43 pm (UTC)(link)
Тут, как говорится, "возможны варианты". Вплоть до продажи БД рекламщикам, если кто-то выявит прадрасположенность гаплотипов к разным покупкам или болезням, использования базы ДНК для определения степени родства без согласия одной из сторон, да и вообще отслеживания перемещения граждан, если сделают компактный прибор для секвенирования. В общем, очередное наступление на анонимность и приватность.

Перспективная Гаттака, так сказать.
Edited 2020-06-06 21:45 (UTC)

[identity profile] litophage.livejournal.com 2020-06-06 10:11 pm (UTC)(link)
Ну, в целом у нас есть кому справляться, а не хватит - наймут еще, бабла то под это отвалили изрядно. Опять же ИМГ присоединяют...
А если в итоге получится"как всегда" - может, оно и к лучшему.

[identity profile] dzz.livejournal.com 2020-06-06 10:38 pm (UTC)(link)
Ну, теперь-то куда деваться, деньги выделили, кто ж скажет "это не мой профиль"? :)))

Получится, наверняка, именно так, поскольку внятной концепции того, зачем эта база нужна, похоже, нет. И это немного успокаивает :)
Edited 2020-06-06 22:39 (UTC)
otawa: (спокойно!)

[personal profile] otawa 2020-06-07 02:00 am (UTC)(link)
Курчатовский последнее время нередко светится во всяких очень странных непрофильных затеях. У меня этот же самый вопрос уже пару раз возникал, только я не запомнила, по каким конкретно поводам.

[identity profile] 14op.livejournal.com 2020-06-07 06:28 am (UTC)(link)
Странная претензия, тащемто. Типа Алексею Кузнецову сказать, что поскольку он физик, то не имел права разрабатывать сетевой стек линупса.

[identity profile] dzz.livejournal.com 2020-06-07 09:15 am (UTC)(link)
Не совсем. Человек-физик волен в свободное время заниматься чем угодно, хоть ядро линукса пилить, хоть огурцы выращивать. Институт - это структура с определёнными целями и планами, и ему внезапная непрофильная активность, в общем, не особо показана. Я, вроде бы, пока больших ИТ-проектов от Курчатовского не наблюдал.
Edited 2020-06-07 09:22 (UTC)

[identity profile] p2004r.livejournal.com 2020-06-07 09:08 am (UTC)(link)
Все эти Grid это как бы "родная" тема физиков со времен БАКа?

Да, быстро хайп прошёл и вот уже люди удивляются :)))

[identity profile] dzz.livejournal.com 2020-06-07 09:20 am (UTC)(link)
Возможно, у меня предвзятое отношение, но "видел я код, написанный физиками" (с), причём, неоднократно :)

Есть сомнения, что систему массового обслуживания, да ещё и high load, сделают хорошо. Не, ну, можно, конечно, найти специалистов, собрать команду, но смысл это делать именно в Курчатнике от меня ускользает.

[identity profile] p2004r.livejournal.com 2020-06-07 09:52 am (UTC)(link)
Я вот про это:

The Worldwide LHC Computing Grid (WLCG) is a global collaboration of computer centres. It was launched in 2002 to provide a resource to store, distribute and analyse the 15 petabytes (15 million gigabytes) of data generated every year by the Large Hadron Collider (LHC).


The most important middleware stacks used in the WLCG are from the European Middleware Initiative, which combines several middleware providers (ARC, gLite, UNICORE and dCache); the Globus Toolkit developed by the Globus Alliance; and the Virtual Data Toolkit.

Ну вот UNICORE например? Что в нем такого плохого? Это проект немецкого МинобраованияИнауки, универовский по сути и физики там идеологи с самого начала.

[identity profile] dzz.livejournal.com 2020-06-08 01:47 am (UTC)(link)
С гридами, всё-таки, другая ситуация - они изначально были нужны именно физикам для анализа данных экспериментов на ускорителях. А тут, по сути, общегосударственная система и консьюмерский продукт.

[identity profile] p2004r.livejournal.com 2020-06-08 08:35 am (UTC)(link)
А тут нужны всему ресерчу работающему с генетикой.

Какая разница, что загружено в эту распределенную базу? Инфраструктура то одна и та же, софт готовый с системой доступа развитой и решенными административными заморочками (только прикладные задачи чуток другие крутиться будут).

Грид это вообще "надмировая система"... Ну никаких проблем не вижу с физиками массово хранящими-обрабатывающими в гриде геномы. Давно так надо было сделать.
tobotras: (Default)

[personal profile] tobotras 2020-06-07 06:59 pm (UTC)(link)
Код обсуждаете, системы, физиков... Директор там теперь -- кого надо друг, вот и все рассуждения.

[identity profile] dzz.livejournal.com 2020-06-07 09:49 pm (UTC)(link)
Не знал, кстати. Это многое объясняет :)